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全切片影像与深度学习

WSI 预处理、patch 采样、内存与 I/O 优化,以及将 gigapixel 图像送入神经网络的常见模式。

WSI 流水线

从扫描仪导出到训练可用的张量,中间包括颜色归一化、组织分割、前景裁剪与多分辨率读取。瓶颈往往在 磁盘 I/O随机 patch 采样 的均衡。

Patch 级与幻灯片级

  • Patch 级:高分辨率细节,适合 CNN / ViT,但需要聚合策略得到切片级结论
  • 幻灯片级:直接对缩略图或嵌入序列建模,依赖高质量的下采样与对齐

工程建议

为每个 slide_id 固定可复现的随机种子与 manifest;在分布式训练下用 分片索引 避免热点读取。